福州新区初期（800平方公里）规划将重点发展三江口、闽江口、滨海新区、环福清湾、环江阴湾等五个重要的城市功能组团。其中：

三江口组团：将重点发展和完善行政办公、医疗文化等公共服务职能，同时利用自贸区落地该区域的优势，发展商务办公、总部基地、商贸会展等生产服务业，打造21世纪海上丝绸之路的经贸平台。

闽江口组团：将依托琅岐岛发展生态休闲旅游业，依托临空经济区发展先进制造业、总部经济、保税物流、创意产业和航空配套服务业。

滨海新区组团：是未来福州中心城区城市功能拓展和转移的重点区域，将按照“绿色开发、立体开发、复合开发”的模式，打造集居住、办公、商贸、旅游等为一体的城市生态新区。

环福清湾组团：将重点进行生态保护，适度发展旅游业，构筑福州新区内的绿色湾区。

环江阴湾组团：主要依托优良的深水港，发展临港产业。其中，江阴工业集中区将重点发展临港重化、电子信息、机械制造、新能源、航运物流等产业；闽台（福州）蓝色经济产业园将推动海洋现代服务业集聚发展，建成重要的现代海洋服务业集聚区；福州保税港区将利用自贸区落地该区域的优势，发展国际航运物流、整车及零配件进出口贸易、保税仓储、保税展示交易以及先进制造业等产业。

同时，新区远景（1892平方公里）规划将构建“一核、一带、两区、三轴”的空间结构。其中：

“一核”：以马尾新城、长乐滨海新城、航空新城等共同构筑的福州新区发展的核心区，是福州主城“东进南下、沿江向海”空间发展战略的重要的拓展空间，也是作为承载福州新兴高端职能的核心区。

“一带”：北接宁德，南接莆田，由北至南串联起福州新区内的罗源、连江、长乐、福清等沿海地区的重要战略空间资源的经济带，是推进“海上福州”建设，实现福州城市由“河口城市”向“沿海城市”转变的重要标志，也是联系福州新区港口、重要产业区的重要纽带。 

“两区”分别为“北翼发展区”和“南翼发展区”。其中，“北翼发展区”：以环罗源湾为主的产业发展区，将依托罗源湾港口作为区域散货枢纽的优势，推动临港产业发展，打造以能源、冶金、机械制造业为主的产业发展区。“南翼发展区”：以福清为发展重点的综合发展区，是推动平潭岛内外一体化的重要对接区域。重点将建设江阴福州新港，对接平潭，依托蓝色产业园、江阴工业集中区、融侨经济技术开发区，发展海洋经济、临港重化、电子信息等产业。

“三轴”分别为“福平综合发展轴”、“南翼区域拓展轴”和“北翼区域拓展轴”。其中，“福平综合发展轴”：为福州中心城区经过滨海新城与平潭联系的轴线，未来重点承担综合服务、区域商贸、总部经济、高端科技研发等职能。“南翼区域拓展轴”：主要依托渔平高速及其西延线等向西联通广大内陆发展腹地，向东联通平潭综合实验区发展轴，是福州对接平潭、辐射内陆和产业发展的重要支撑。“北翼区域拓展轴”：主要依托罗源湾区域联通宁古高速、宁景铁路，向西辐射广大内陆发展的轴线，是发挥福州区域带动能力，带动北部环罗源湾发展区及内陆腹地发展的重要支撑。